优化磨料水射流切割需要注意手头的特定情况，但可以提供出色的生产率提升。使用小刀头（例如 25-hp 刀头）切割 0.100 英寸以下的材料。切割大于 0.020 英寸的气隙是不明智的，因为射流会在间隙中打开并粗略地切割较低的水平。将材料片材紧密堆叠在一起可以防止这种情况发生。以每英寸成本（即系统制造的零件数量）而不是每小时成本来衡量生产率。 事实上，快速生产对于摊销间接成本是必要的。

经常刺穿复合材料、玻璃和石头的水刀应该有能够降低和提高水压的控制器。 真空辅助和其他技术提高了在不损坏目标材料的情况下成功刺穿脆性或层压材料的可能性。

只有当物料搬运占零件生产成本的很大一部分时，物料搬运自动化才有意义。 磨料水射流机器通常使用手动卸载，而板材切割主要使用自动化。

普通自来水为大多数水刀系统供水，90% 的水刀操作员在将水送入入口过滤器之前除了软化水外不进行任何准备工作。 使用反渗透和去离子器净化水可能很诱人，但去除离子会使水更容易从泵和高压管道中的金属中吸收离子。 它可以延长节流孔的寿命，但高压气缸、止回阀和端盖的更换成本要高得多。

水下切割可减少磨料水射流切割顶部边缘的表面结霜（也称为“起雾”），同时还大大降低了射流噪音和工作场所的混乱。 然而，这确实会降低喷气机的能见度，因此建议使用电子性能监控来检测与峰值条件的偏差并在任何部件损坏之前停止系统。